Het is 1908. Grete heeft een grote belangstelling voor botanische fotografie en meldt zich aan bij de universiteit, in een tijd waarin nog maar weinig vrouwen haar zijn voorgegaan. In 1972 wordt literatuurstudent Hannes verliefd op biologiestudente Gundula, die onderzoek doet naar geraniums. Wanneer zij vertrekt en hij de zorg voor haar planten overneemt, groeit er een onverwachte band tussen hem en de planten. In 2020 strandt neurowetenschapper Tony Wong tijdens de coronapandemie op een vrijwel verlaten campus. Geïnspireerd door het onderzoek van biologe Alice stelt hij zich een vraag: kunnen planten voelen? Hij besluit Alice’s ideeën te testen op de gingkoboom.

Grote en kleine vragen wisselen elkaar af: over liefde, wetenschap en de manier waarop de mens zich verhoudt tot de natuur. Elk tijdperk wordt anders in beeld gebracht, van zwart-wit op 35mm tot kleur op 16mm en digitale beelden. Zo wordt het verstrijken van de tijd niet alleen verteld, maar ook zichtbaar gemaakt. Silent Friend is een ambitieuze film waarin de mens passeert en de natuur blijft staan.