Choo is zestien en een school drop-out. Daarom sturen haar ouders haar naar een autoritaire eliteschool in Singapore. Ook daar blijft ze zich verzetten tegen de strenge docenten, iets wat al snel opvalt bij drie andere buitenbeentjes: Sofia, Gina en Vanessa. Zij voelen dezelfde drang om tegen de regels aan te schoppen, en al snel zijn de vier onafscheidelijk. Wanneer Sofia’s chauffeur, Oom Phoon, vertelt over de beruchte triadebendes uit het koloniale Singapore, ontstaat een ambitieus plan: waarom beginnen ze niet hun eigen bende? Maar rebelleren blijkt lastig in een stad als Singapore.

De titel van de film refereert aan een ‘amoebe’: een eencellig organisme dat losstaat van de wereld om zich heen en overleeft door zich te isoleren. In haar warme speelfilmdebuut Amoeba gebruikt Tan Siyou die metafoor voor vier vriendinnen die zich ook buiten hun omgeving voelen staan, maar juist in elkaars gezelschap én gedeelde rebellie een plek vinden om te groeien.